Junta provisional de Gobierno – 1903
Tras la separación de Panamá de Colombia, el 3 de noviembre de 1903, la Junta Provisional de Gobierno aprobó el Decreto No. 14 de 9 de noviembre del mismo año, que organizó provisionalmente los ministerios de Estado entre los que se encontraba el Ministerio de Gobierno.
Entre las funciones que se le asignaron al Ministerio de Gobierno en ese entonces, se encontraba todo lo relacionado con el orden público, policía, divisiones territoriales, elecciones populares, decretos y leyes de la República.
Además, dentro de su competencia también le correspondía la revisión y suspensión de los acuerdos municipales y las resoluciones de los prefectos y alcaldes; impresiones oficiales, archivos nacionales, intérpretes públicos, correos, telégrafos; Higiénicos y Beneficiarios públicos; Cuerpo de Bomberos; Convención Constituyente; Asamblea legislativa; agencias de navegación por vapor, empresa de tranvía, compañía del canal y del ferrocarril de Panamá, preparar los proyectos sobre legislación en materia de régimen político y otras instancias que se establezcan en el Istmo.
Ministros de Gobierno y Justicia
| Período | Ministro | Período | Ministro |
|---|---|---|---|
| 1903-1917-1921 | Eusebio A. Morales | 1959-1960 | Héctor Valdés |
| 1904 | Tomás A. Arias | 1960-1963 | Marcos Aurelio Robles |
| 1905 | Santiago de la Guardia | 1963-1964 | Max Arosemena |
| 1906 | Ricardo Arias | 1964-1964 | Gonzalo Tapia |
| 1908 | Arístides Arjona | 1964-1965 | César Arrocha |
| 1909-1910 | Ramón Valdés | 1965-1965 | Targidio Bernal |
| 1911 | Heliodoro Patiño | 1965-1967 | José Bazán |
| 1912 | Salvador Jurado | 1967-1967 | Fabio Velarde |
| 1913 | Ramón F. Acevedo | 1967-1968 | Joaquín Franco |
| 1914 | Francisco Filós | 1968-1969 | Eduardo Morgan |
| 1915-1916 | Juan B. Sosa | 1969-1969 | Modesto Justiniani |
| 1916-1917/1935-1937 | Héctor Valdés | 1969-1969 | José Guillermo Aizpú |
| Aldreano Robles Méndez | 1970-1970 | Pedro Julio Pérez | |
| Ricardo J. Alfaro | 1970-1971 | Alejandro Ferrer | |
| 1923-1924 | Roberto F. Chiari | 1971-1974 | Juan Materno Vásquez |
| 1924 | Rafael Neira A. | 1974-1976/1980-1980 | Ricardo Rodríguez |
| 1925-1928 | Carlos L. López | 1976-1978 | Jorge Castro |
| 1929-1930 | Andrés Robles | 1976-1976 | Cesar Rodríguez |
| 1930 | Daniel Ballen | 1978-1980 | Adolfo Ahumada |
| 1931 | Francisco A. Paredes | 1981-1982 | Jorge E. Ritter |
| 1931-1932 | Guillermo Andreve | 1982-1983 | Justo Fidel Palacios |
| Harmodio Arias | 1983-1984 | Carlos O. Tipaldos | |
| 1933 | Juan A. Jiménez | 1984-1984/1986-1989 | Rodolfo Chiari |
| 1934-1935 | Galileo Solís | 1984-1985 | Carlos De Sedas, Hijo |
| 1939 | Leopoldo Arosemena | 1985-1986 | Jorge Ricardo Riba |
| 1942 | Camilo De La Guardia | 1989-1989 | Olmedo Miranda |
| 1943-1945 | Francisco A. Filós hijo | 1989 | Renato Pereira |
| 1945 | Alfonso Correa G. | 1989-1991 | Ricardo Arias Calderón |
| 1946-1947 | Carlos Sucre | 1991-1994 | Juan Bautista Chevalier |
| 1947 | Francisco Solís | 1994 | Jacobo Salas |
| 1948 | Jacinto López y León | 1994-1998 | Raúl Montenegro Diviazo |
| 1948-1949 | José Daniel Crespo | 1998-1999 | Mariela Sagel |
| 1949 | Abilio Bellido | 1999-2001 | Winston Spadafora Franco |
| 1949-1951 | Alfredo Alemán | 2001-2002 | Aníbal Salas |
| 1951 | José C. de Obaldía | 2002-2004 | Arnulfo Escalona Ávila |
| 1951-1952 | Miguel Ángel Ordoñez | 2004-2006 | Héctor B. Alemán E. |
| 1952 | Raúl De Roux | 2006-2007 | Olga Golcher |
| 1952 | Catalino Arrocha Grael | 2007-2008 | Daniel Delgado Diamante |
| 1955-1956 | Alejandro R. Cantera | 2008-2009 | Dilio Arcia Torres |
| 1956/1957/1958 | Max Heurtemate | 2010-2010 | José Raúl Mulino |
| 1957-1958 | Humberto Fassano | 2010-2012 | Roxana Méndez |
| 1959-1959/1965-1967 | José Dominador Bazán | 2012-2014 | Jorge Ricardo Fábrega |
| 2014 | Milton Henríquez |